Tripeptide Composition Descriptor
References
M. Bhasin, G. P. S. Raghava. Classification of Nuclear Receptors Based on Amino Acid Composition and Dipeptide Composition. Journal of Biological Chemistry, 2004, 279, 23262.
See also
See extractProtAAC and extractProtDC
for Amino Acid Composition and Dipeptide Composition descriptors.
Examples
x = readFASTA(system.file('protseq/P00750.fasta', package = 'Rcpi'))[[1]]
extractProtTC(x)
#> AAA RAA NAA DAA CAA EAA
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> QAA GAA HAA IAA LAA KAA
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#> MAA FAA PAA SAA TAA WAA
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#> YAA VAA ARA RRA NRA DRA
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> CRA ERA QRA GRA HRA IRA
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#> LRA KRA MRA FRA PRA SRA
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#> TRA WRA YRA VRA ANA RNA
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#> NNA DNA CNA ENA QNA GNA
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#> PNA SNA TNA WNA YNA VNA
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#> ADA RDA NDA DDA CDA EDA
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#> QDA GDA HDA IDA LDA KDA
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#> MDA FDA PDA SDA TDA WDA
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#> YDA VDA ACA RCA NCA DCA
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#> CCA ECA QCA GCA HCA ICA
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#> LCA KCA MCA FCA PCA SCA
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#> TCA WCA YCA VCA AEA REA
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#> NEA DEA CEA EEA QEA GEA
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#> HEA IEA LEA KEA MEA FEA
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#> PEA SEA TEA WEA YEA VEA
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#> YQA VQA AGA RGA NGA DGA
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#> CGA EGA QGA GGA HGA IGA
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#> LGA KGA MGA FGA PGA SGA
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#> TGA WGA YGA VGA AHA RHA
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#> AIA RIA NIA DIA CIA EIA
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#> QMA GMA HMA IMA LMA KMA
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#> MMA FMA PMA SMA TMA WMA
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#> YMA VMA AFA RFA NFA DFA
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#> NPA DPA CPA EPA QPA GPA
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#> HPA IPA LPA KPA MPA FPA
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#> PPA SPA TPA WPA YPA VPA
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#> ASA RSA NSA DSA CSA ESA
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> QSA GSA HSA ISA LSA KSA
#> 0.000000000 0.001785714 0.000000000 0.000000000 0.001785714 0.000000000
#> MSA FSA PSA SSA TSA WSA
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#> YSA VSA ATA RTA NTA DTA
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#> CTA ETA QTA GTA HTA ITA
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#> LTA KTA MTA FTA PTA STA
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#> QYA GYA HYA IYA LYA KYA
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#> MYA FYA PYA SYA TYA WYA
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#> YYA VYA AVA RVA NVA DVA
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#> CVA EVA QVA GVA HVA IVA
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#> LVA KVA MVA FVA PVA SVA
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#> TVA WVA YVA VVA AAR RAR
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#> NAR DAR CAR EAR QAR GAR
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.001785714
#> HAR IAR LAR KAR MAR FAR
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#> PAR SAR TAR WAR YAR VAR
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#> ARR RRR NRR DRR CRR ERR
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#> QRR GRR HRR IRR LRR KRR
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#> MRR FRR PRR SRR TRR WRR
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#> YRR VRR ANR RNR NNR DNR
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#> CNR ENR QNR GNR HNR INR
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> LNR KNR MNR FNR PNR SNR
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#> TNR WNR YNR VNR ADR RDR
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> NDR DDR CDR EDR QDR GDR
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> HDR IDR LDR KDR MDR FDR
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> PDR SDR TDR WDR YDR VDR
#> 0.001785714 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> ACR RCR NCR DCR CCR ECR
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> QCR GCR HCR ICR LCR KCR
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.001785714 0.000000000 0.000000000
#> MCR FCR PCR SCR TCR WCR
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> YCR VCR AER RER NER DER
#> 0.003571429 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> CER EER QER GER HER IER
#> 0.000000000 0.000000000 0.001785714 0.001785714 0.000000000 0.000000000
#> LER KER MER FER PER SER
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.001785714
#> TER WER YER VER AQR RQR
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> NQR DQR CQR EQR QQR GQR
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> HQR IQR LQR KQR MQR FQR
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#> PQR SQR TQR WQR YQR VQR
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> AGR RGR NGR DGR CGR EGR
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.001785714 0.000000000 0.000000000
#> QGR GGR HGR IGR LGR KGR
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.001785714 0.000000000
#> MGR FGR PGR SGR TGR WGR
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.003571429 0.000000000 0.000000000
#> YGR VGR AHR RHR NHR DHR
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> CHR EHR QHR GHR HHR IHR
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> LHR KHR MHR FHR PHR SHR
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#> THR WHR YHR VHR AIR RIR
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#> NIR DIR CIR EIR QIR GIR
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> HIR IIR LIR KIR MIR FIR
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#> PIR SIR TIR WIR YIR VIR
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#> ALR RLR NLR DLR CLR ELR
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
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#> NMR DMR CMR EMR QMR GMR
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#> PMR SMR TMR WMR YMR VMR
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#> AFR RFR NFR DFR CFR EFR
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#> QFR GFR HFR IFR LFR KFR
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#> YFR VFR APR RPR NPR DPR
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#> CPR EPR QPR GPR HPR IPR
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#> LPR KPR MPR FPR PPR SPR
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#> TPR WPR YPR VPR ASR RSR
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#> MTR FTR PTR STR TTR WTR
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#> YTR VTR AWR RWR NWR DWR
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#> CWR EWR QWR GWR HWR IWR
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#> LWR KWR MWR FWR PWR SWR
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#> HYR IYR LYR KYR MYR FYR
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#> PYR SYR TYR WYR YYR VYR
#> 0.000000000 0.001785714 0.001785714 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> AVR RVR NVR DVR CVR EVR
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#> YVR VVR AAN RAN NAN DAN
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#> LAN KAN MAN FAN PAN SAN
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#> TAN WAN YAN VAN ARN RRN
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#> ANN RNN NNN DNN CNN ENN
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#> QNN GNN HNN INN LNN KNN
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#> NCN DCN CCN ECN QCN GCN
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#> HCN ICN LCN KCN MCN FCN
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#> AEN REN NEN DEN CEN EEN
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#> QEN GEN HEN IEN LEN KEN
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#> MEN FEN PEN SEN TEN WEN
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#> YEN VEN AQN RQN NQN DQN
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#> HGN IGN LGN KGN MGN FGN
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#> PGN SGN TGN WGN YGN VGN
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#> QHN GHN HHN IHN LHN KHN
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#> MHN FHN PHN SHN THN WHN
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#> YHN VHN AIN RIN NIN DIN
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> CIN EIN QIN GIN HIN IIN
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#> LIN KIN MIN FIN PIN SIN
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#> TIN WIN YIN VIN ALN RLN
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
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#> HLN ILN LLN KLN MLN FLN
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#> PLN SLN TLN WLN YLN VLN
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#> AKN RKN NKN DKN CKN EKN
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#> QKN GKN HKN IKN LKN KKN
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#> MKN FKN PKN SKN TKN WKN
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#> YKN VKN AMN RMN NMN DMN
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> CMN EMN QMN GMN HMN IMN
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#> LMN KMN MMN FMN PMN SMN
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> TMN WMN YMN VMN AFN RFN
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> NFN DFN CFN EFN QFN GFN
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#> HFN IFN LFN KFN MFN FFN
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#> PFN SFN TFN WFN YFN VFN
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> APN RPN NPN DPN CPN EPN
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> QPN GPN HPN IPN LPN KPN
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> MPN FPN PPN SPN TPN WPN
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> YPN VPN ASN RSN NSN DSN
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.001785714 0.000000000 0.000000000
#> CSN ESN QSN GSN HSN ISN
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#> LSN KSN MSN FSN PSN SSN
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#> TSN WSN YSN VSN ATN RTN
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> NTN DTN CTN ETN QTN GTN
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#> PTN STN TTN WTN YTN VTN
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#> YWN VWN AYN RYN NYN DYN
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#> LYN KYN MYN FYN PYN SYN
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#> MAD FAD PAD SAD TAD WAD
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#> 0.001785714 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.001785714
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#> NND DND CND END QND GND
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#> ADD RDD NDD DDD CDD EDD
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#> LCD KCD MCD FCD PCD SCD
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#> HED IED LED KED MED FED
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#> PED SED TED WED YED VED
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#> QID GID HID IID LID KID
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#> MID FID PID SID TID WID
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#> AMD RMD NMD DMD CMD EMD
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#> QMD GMD HMD IMD LMD KMD
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#> MMD FMD PMD SMD TMD WMD
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#> YMD VMD AFD RFD NFD DFD
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#> CFD EFD QFD GFD HFD IFD
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#> NPD DPD CPD EPD QPD GPD
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#> QSD GSD HSD ISD LSD KSD
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#> MSD FSD PSD SSD TSD WSD
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#> YSD VSD ATD RTD NTD DTD
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> CTD ETD QTD GTD HTD ITD
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#> LTD KTD MTD FTD PTD STD
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#> TTD WTD YTD VTD AWD RWD
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#> NWD DWD CWD EWD QWD GWD
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
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#> PWD SWD TWD WWD YWD VWD
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> AYD RYD NYD DYD CYD EYD
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> QYD GYD HYD IYD LYD KYD
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> MYD FYD PYD SYD TYD WYD
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.001785714 0.000000000
#> YYD VYD AVD RVD NVD DVD
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> CVD EVD QVD GVD HVD IVD
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> LVD KVD MVD FVD PVD SVD
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> TVD WVD YVD VVD AAC RAC
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#> NAC DAC CAC EAC QAC GAC
#> 0.000000000 0.001785714 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> HAC IAC LAC KAC MAC FAC
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#> PAC SAC TAC WAC YAC VAC
#> 0.001785714 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> ARC RRC NRC DRC CRC ERC
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#> QRC GRC HRC IRC LRC KRC
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> MRC FRC PRC SRC TRC WRC
#> 0.000000000 0.000000000 0.001785714 0.003571429 0.000000000 0.000000000
#> YRC VRC ANC RNC NNC DNC
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#> CNC ENC QNC GNC HNC INC
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#> LNC KNC MNC FNC PNC SNC
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#> TNC WNC YNC VNC ADC RDC
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#> NDC DDC CDC EDC QDC GDC
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#> HDC IDC LDC KDC MDC FDC
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#> PDC SDC TDC WDC YDC VDC
#> 0.000000000 0.001785714 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> ACC RCC NCC DCC CCC ECC
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#> QCC GCC HCC ICC LCC KCC
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#> MCC FCC PCC SCC TCC WCC
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#> YCC VCC AEC REC NEC DEC
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#> CEC EEC QEC GEC HEC IEC
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#> LEC KEC MEC FEC PEC SEC
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#> TEC WEC YEC VEC AQC RQC
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#> NQC DQC CQC EQC QQC GQC
#> 0.000000000 0.000000000 0.001785714 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> HQC IQC LQC KQC MQC FQC
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#> PQC SQC TQC WQC YQC VQC
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#> AGC RGC NGC DGC CGC EGC
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#> QGC GGC HGC IGC LGC KGC
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#> MGC FGC PGC SGC TGC WGC
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#> YGC VGC AHC RHC NHC DHC
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#> CHC EHC QHC GHC HHC IHC
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#> LHC KHC MHC FHC PHC SHC
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#> THC WHC YHC VHC AIC RIC
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#> NIC DIC CIC EIC QIC GIC
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#> HIC IIC LIC KIC MIC FIC
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#> PIC SIC TIC WIC YIC VIC
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#> ALC RLC NLC DLC CLC ELC
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#> QLC GLC HLC ILC LLC KLC
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#> MLC FLC PLC SLC TLC WLC
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#> YLC VLC AKC RKC NKC DKC
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#> CKC EKC QKC GKC HKC IKC
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#> LKC KKC MKC FKC PKC SKC
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#> TKC WKC YKC VKC AMC RMC
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#> NMC DMC CMC EMC QMC GMC
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#> HMC IMC LMC KMC MMC FMC
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#> PMC SMC TMC WMC YMC VMC
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#> AFC RFC NFC DFC CFC EFC
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#> QFC GFC HFC IFC LFC KFC
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#> MFC FFC PFC SFC TFC WFC
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#> YFC VFC APC RPC NPC DPC
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#> CPC EPC QPC GPC HPC IPC
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#> LPC KPC MPC FPC PPC SPC
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#> TPC WPC YPC VPC ASC RSC
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#> NSC DSC CSC ESC QSC GSC
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#> PSC SSC TSC WSC YSC VSC
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#> ATC RTC NTC DTC CTC ETC
#> 0.001785714 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> QTC GTC HTC ITC LTC KTC
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#> MTC FTC PTC STC TTC WTC
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#> YTC VTC AWC RWC NWC DWC
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#> NYC DYC CYC EYC QYC GYC
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#> HYC IYC LYC KYC MYC FYC
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#> PYC SYC TYC WYC YYC VYC
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#> AVC RVC NVC DVC CVC EVC
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#> MVC FVC PVC SVC TVC WVC
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#> YVC VVC AAE RAE NAE DAE
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#> QNE GNE HNE INE LNE KNE
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#> YNE VNE ADE RDE NDE DDE
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#> CDE EDE QDE GDE HDE IDE
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#> LDE KDE MDE FDE PDE SDE
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#> TDE WDE YDE VDE ACE RCE
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#> NCE DCE CCE ECE QCE GCE
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#> HCE ICE LCE KCE MCE FCE
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#> PCE SCE TCE WCE YCE VCE
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#> QEE GEE HEE IEE LEE KEE
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#> MEE FEE PEE SEE TEE WEE
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#> YEE VEE AQE RQE NQE DQE
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#> CQE EQE QQE GQE HQE IQE
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#> LQE KQE MQE FQE PQE SQE
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.001785714 0.000000000 0.001785714
#> TQE WQE YQE VQE AGE RGE
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#> 0.001785714 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
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#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.001785714 0.000000000 0.000000000
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#> HIG IIG LIG KIG MIG FIG
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#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
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#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
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#> PMG SMG TMG WMG YMG VMG
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#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.003571429 0.000000000 0.001785714
#> NSG DSG CSG ESG QSG GSG
#> 0.001785714 0.001785714 0.000000000 0.003571429 0.000000000 0.000000000
#> HSG ISG LSG KSG MSG FSG
#> 0.000000000 0.000000000 0.001785714 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> PSG SSG TSG WSG YSG VSG
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.001785714 0.000000000
#> ATG RTG NTG DTG CTG ETG
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> QTG GTG HTG ITG LTG KTG
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#> MTG FTG PTG STG TTG WTG
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> YTG VTG AWG RWG NWG DWG
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> CWG EWG QWG GWG HWG IWG
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
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#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.001785714
#> TWG WWG YWG VWG AYG RYG
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> NYG DYG CYG EYG QYG GYG
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.001785714
#> HYG IYG LYG KYG MYG FYG
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> PYG SYG TYG WYG YYG VYG
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> AVG RVG NVG DVG CVG EVG
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#> QVG GVG HVG IVG LVG KVG
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.001785714 0.000000000
#> MVG FVG PVG SVG TVG WVG
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#> YVG VVG AAH RAH NAH DAH
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#> CAH EAH QAH GAH HAH IAH
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#> LAH KAH MAH FAH PAH SAH
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#> HEI IEI LEI KEI MEI FEI
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#> PEI SEI TEI WEI YEI VEI
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#> PML SML TML WML YML VML
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#> PTK STK TTK WTK YTK VTK
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#> AWK RWK NWK DWK CWK EWK
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> QWK GWK HWK IWK LWK KWK
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#> MWK FWK PWK SWK TWK WWK
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#> YWK VWK AYK RYK NYK DYK
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> CYK EYK QYK GYK HYK IYK
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> LYK KYK MYK FYK PYK SYK
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> TYK WYK YYK VYK AVK RVK
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> NVK DVK CVK EVK QVK GVK
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#> HVK IVK LVK KVK MVK FVK
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#> PVK SVK TVK WVK YVK VVK
#> 0.001785714 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> AAM RAM NAM DAM CAM EAM
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#> QAM GAM HAM IAM LAM KAM
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> MAM FAM PAM SAM TAM WAM
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#> YAM VAM ARM RRM NRM DRM
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#> ASM RSM NSM DSM CSM ESM
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#> TNF WNF YNF VNF ADF RDF
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#> NDF DDF CDF EDF QDF GDF
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#> HDF IDF LDF KDF MDF FDF
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#> PDF SDF TDF WDF YDF VDF
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#> ACF RCF NCF DCF CCF ECF
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#> QCF GCF HCF ICF LCF KCF
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#> MCF FCF PCF SCF TCF WCF
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#> YCF VCF AEF REF NEF DEF
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#> CEF EEF QEF GEF HEF IEF
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#> LEF KEF MEF FEF PEF SEF
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#> TEF WEF YEF VEF AQF RQF
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#> NQF DQF CQF EQF QQF GQF
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> HQF IQF LQF KQF MQF FQF
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> PQF SQF TQF WQF YQF VQF
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#> MGF FGF PGF SGF TGF WGF
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> YGF VGF AHF RHF NHF DHF
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> CHF EHF QHF GHF HHF IHF
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#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> THF WHF YHF VHF AIF RIF
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.001785714 0.000000000
#> NIF DIF CIF EIF QIF GIF
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> HIF IIF LIF KIF MIF FIF
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
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#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
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#> YLF VLF AKF RKF NKF DKF
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#> HMF IMF LMF KMF MMF FMF
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#> PMF SMF TMF WMF YMF VMF
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#> AFF RFF NFF DFF CFF EFF
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#> QFF GFF HFF IFF LFF KFF
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#> MFF FFF PFF SFF TFF WFF
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
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#> CPF EPF QPF GPF HPF IPF
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#> LPF KPF MPF FPF PPF SPF
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#> TPF WPF YPF VPF ASF RSF
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#> NSF DSF CSF ESF QSF GSF
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#> PSF SSF TSF WSF YSF VSF
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#> ATF RTF NTF DTF CTF ETF
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#> MTF FTF PTF STF TTF WTF
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#> YTF VTF AWF RWF NWF DWF
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
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#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
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#> YVF VVF AAP RAP NAP DAP
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#> CAP EAP QAP GAP HAP IAP
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#> TAP WAP YAP VAP ARP RRP
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#> ANP RNP NNP DNP CNP ENP
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#> YNP VNP ADP RDP NDP DDP
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#> CDP EDP QDP GDP HDP IDP
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#> LDP KDP MDP FDP PDP SDP
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#> TDP WDP YDP VDP ACP RCP
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#> NCP DCP CCP ECP QCP GCP
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#> HCP ICP LCP KCP MCP FCP
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#> PCP SCP TCP WCP YCP VCP
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#> AEP REP NEP DEP CEP EEP
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> QEP GEP HEP IEP LEP KEP
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#> MEP FEP PEP SEP TEP WEP
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#> AHP RHP NHP DHP CHP EHP
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#> QHP GHP HHP IHP LHP KHP
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> MHP FHP PHP SHP THP WHP
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#> YHP VHP AIP RIP NIP DIP
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#> CIP EIP QIP GIP HIP IIP
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#> LIP KIP MIP FIP PIP SIP
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#> TIP WIP YIP VIP ALP RLP
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> NLP DLP CLP ELP QLP GLP
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#> HLP ILP LLP KLP MLP FLP
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#> PLP SLP TLP WLP YLP VLP
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> AKP RKP NKP DKP CKP EKP
#> 0.001785714 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> QKP GKP HKP IKP LKP KKP
#> 0.001785714 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> MKP FKP PKP SKP TKP WKP
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.001785714 0.000000000 0.000000000
#> YKP VKP AMP RMP NMP DMP
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> CMP EMP QMP GMP HMP IMP
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> LMP KMP MMP FMP PMP SMP
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#> TMP WMP YMP VMP AFP RFP
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#> NFP DFP CFP EFP QFP GFP
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#> PFP SFP TFP WFP YFP VFP
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> APP RPP NPP DPP CPP EPP
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#> QPP GPP HPP IPP LPP KPP
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#> MPP FPP PPP SPP TPP WPP
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#> YPP VPP ASP RSP NSP DSP
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#> LSP KSP MSP FSP PSP SSP
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#> TSP WSP YSP VSP ATP RTP
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#> HTP ITP LTP KTP MTP FTP
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#> PTP STP TTP WTP YTP VTP
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#> QAS GAS HAS IAS LAS KAS
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#> TCS WCS YCS VCS AES RES
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#> CTS ETS QTS GTS HTS ITS
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#> AYS RYS NYS DYS CYS EYS
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#> MYS FYS PYS SYS TYS WYS
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#> YYS VYS AVS RVS NVS DVS
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#> CVS EVS QVS GVS HVS IVS
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#> TVS WVS YVS VVS AAT RAT
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#> TDW WDW YDW VDW ACW RCW
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#> AEW REW NEW DEW CEW EEW
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> QEW GEW HEW IEW LEW KEW
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#> MEW FEW PEW SEW TEW WEW
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#> YEW VEW AQW RQW NQW DQW
#> 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000
#> CQW EQW QQW GQW HQW IQW
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#> HYV IYV LYV KYV MYV FYV
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#> PYV SYV TYV WYV YYV VYV
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#> AVV RVV NVV DVV CVV EVV
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